常用的飲用水消毒方式可分為物理消毒和化學消毒。物理消毒主要是通過紫外線照射，而化學消毒根據消毒劑的種類可分為氯消毒和臭氧消毒。其中，氯消毒是集中式供水主要的消毒方式，依據消毒原理的不同，可分為游離氯消毒和化合氯消毒。主要的含氯消毒劑包括液氯、一氯胺、二氯胺、二氧化氯和次氯酸鈉等。臭氧消毒是以強氧化劑臭氧進行消毒。為提高飲用水消毒效果，近年來
飲用水消毒檢測已開始將不同消毒方法聯合使用來進行飲用水消毒。
氯消毒是早被采用的飲用水消毒方式，具有技術成熟穩定、殺菌能力強、持續時間久、成本低廉等眾多優點。目前，我國城鄉集中某供水水廠均采用氯消毒工藝對飲用水進行消毒。而自來水制造一般都用氯來消毒，大的自來水廠一般用液氯消毒。關于該種消毒技術可能產生兩個副作用：
1.加氯后，水中的氯及氯與水中有機物反應后生成的消毒副產物（CHCl?、CCl?、ClCH?COOH等）對人體是有害的，可能產生三致（致癌、致突變、致異變）；
2.如果液氯鋼瓶有泄漏，對工作人員及附近居民有害。Cl是有毒氣體，戰爭時期曾作為毒氣施放，液氯泄漏事故也曾見諸報端。
但我們并不會因為氯有這些缺點和副作用，就不采用氯消毒。目前，世界上絕大多數自來水廠，不管是發達國家還是國內，都還是要采用加氯消毒的方法。
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